1980年1月18日建所后，社会学所最初设立了二个研究组：社会组与人口组，1981年人口组整体调出；社会组分为：社会理论组，婚姻家庭组，城乡组。
1983年正式成立了3个研究室：社会学理论研究室，张之毅任室主任；城乡研究室，张雨林任室主任，王晓义任副主任；家庭婚姻研究室，刘英任室主任；另设编译室，王育民、陈一筠任副主任；并开始筹建社会心理学研究室。
1985年1月，青少年研究所并入社会学研究所，重新调整了机构设置，设6个研究室：社会学理论研究室，宋家鼎任主任，杨雅彬任副主任；城乡研究室更名为城乡发展研究室，朱庆芳任主任，李汉林任副主任；家庭婚姻研究室更名为生活方式与婚姻家庭研究室，刘英任主任，马有才任副主任；青少年研究室，谢昌逵任主任，单光鼐任副主任；社会心理学研究室，徐凤姝任主任，李庆善任副主任；国外社会学研究室，刘成彬、陈一筠任副主任。
1988年对部分处室领导做了调整：社会学理论研究室，苏国勋任主任；生活方式与婚姻家庭研究室，戴可景任主任；社会心理学研究室，李庆善任主任；青少年研究室，楼静波任主任。
1989年增设农村社会学研究室，张厚义任主任。
1991年增设工业社会学研究室，并调整部分研究室名称。生活方式与婚姻家庭研究室改为家庭社会学研究室，城乡发展研究室改为城市社会学研究室。全所共设7个研究室：社会学理论研究室，苏国勋任主任，张旅平任副主任；家庭社会学研究室，马有才任副主任（后任主任）；城市社会学研究室，朱庆芳任主任，折晓叶任副主任；青少年研究室，楼静波任主任，单光鼐任副主任；社会心理学研究室，李庆善任主任，邵道生任副主任；农村社会学研究室，张厚义任主任；工业社会学研究室，李培林任副主任。同年，撤销国外社会学研究室。
1994年，增设社会学调查与方法研究室。全所共设8个研究室，社会学理论研究室，苏国勋任主任，张旅平任副主任；家庭社会学研究室，马有才任主任，李银河任副主任（1996年李银河任主任，王震宇任副主任）；城市社会学研究室，李汉林任主任，折晓叶任副主任；青少年研究室，单光鼐任主任，陆建华任副主任；社会心理学研究室，李庆善任主任，杨宜音任副主任；农村社会学研究室，张厚义任主任，陈斗仁、牛凤瑞任副主任；工业社会学研究室，黄平、石秀印任副主任；社会学调查与方法研究室，沈崇麟任主任。
1999年，增设社会保障研究室，后改为社会政策研究室。全所共设9个研究室，其中，社会心理学研究室，杨宜音任主任；社会政策研究室，杨团任主任；其他研究室不变，原主任（副主任）连任。
2000年，农村社会学研究室与工业社会学研究室合并，更名为农村与产业社会学研究室，王晓毅任主任。
2002年，部分处室领导调整。张旅平任社会学理论研究室主任，渠敬东任副主任；陈午晴任社会心理学研究室副主任；王春光任农村与产业社会学研究室副主任。
2003年12月增设社会人类学研究室，调整部分研究室名称。社会学理论研究室更名为社会理论研究室，家庭社会学研究室更名为家庭与性别研究室，城市社会学研究室更名为组织与社区研究室，青少年研究室更名为青少年与社会问题研究室。全所共设9个研究室，社会理论研究室，张旅平任主任；家庭与性别研究室，李银河任主任，王震宇任副主任；组织与社区研究室，折晓叶任主任；青少年与社会问题研究室，陈昕任主任，吴小英任副主任；社会心理学研究室，杨宜音任主任，陈午晴任副主任；农村与产业社会学研究室，王晓毅任主任，王春光任副主任；社会学调查与方法研究室，陈婴婴任主任；社会政策研究室，杨团任主任；社会人类学研究室，罗红光任主任。
2006年新增设社会发展研究室，陈光金任主任，李炜任副主任。葛道顺任社会政策室副主任，夏传玲任社会学调查与方法研究室副主任。
2009年2月，处室主任换届调整。至此，全所共有10个研究室，即：社会理论研究室，张旅平任主任；家庭与性别研究室，吴小英任主任；组织与社区研究室，王颖任主任，沈红任副主任；青少年与社会问题研究室，陈昕任主任，李春玲任副主任；社会心理学研究室，杨宜音任主任，李原任副主任；农村与产业社会学研究室，王晓毅任主任；社会学调查与方法研究室，夏传玲任主任；社会政策研究室，王春光任主任，葛道顺任副主任；社会人类学研究室，罗红光任主任；社会发展研究室，李炜任主任。
2019年5月，启动全所学科调整，优化了社会学研究所学科布局，针对人工智能和互联网等新技术发展给社会发展和变迁带来的新影响，以及新时代社会矛盾和社会结构变动提出的新的重大研究问题，新增“社会工作与福利社会学”、“经济与科技社会学”两个新兴分支学科研究室；撤销“社会政策”和“社会人类学”两个学科（研究室）。新成立“经济与科技社会学研究室”，“社会工作与福利社会学研究室”，完成撤销的两个分支学科研究室的跨所调整工作。根据实际需求和学科发展趋势，修改了5个分支学科研究室的名称：原“组织与社区研究室”更名为“城市社会学研究室”，原“农村与产业社会学研究室”更名为“农村社会学研究室”，原“青少年与社会问题研究室”更名为“青少年与教育社会学研究室”，原“社会发展研究室”更名为“发展社会学研究室”，原“家庭与性别研究室”更名为“性别与家庭社会学研究室”。另外有社会理论、社会调查与方法、社会心理学、廉政学等4个分支学科研究室保留了原名称。
截止到2024年10月，中国社会科学院社会学研究所机构设置如下：
所长：陈光金
副所长：王春光
纪委书记、副所长：白晓丽
党委副书记、副所长：杨典
学术委员会
主任：陈光金
副主任：杨典
委员：陈光金、杨典、王春光、李春玲、吴小英、夏传玲、李炜、何蓉、王俊秀、王晓毅、李培林、赵延东、王天夫
专业职称评审委员会
主任：陈光金
副主任：杨典
委员：陈光金、杨典、王春光、吕鹏、朱迪、吴小英、何蓉、张丽萍、赵联飞、张翼、刘亚秋、辛自强、周飞舟
社会理论研究室
主任：赵立伟
副主任：陈涛
成员：何蓉(女)、李荣荣(女)
社会调查与方法研究室
主任：赵联飞
副主任：赵锋
成员：马妍(女)、徐法寅、王金水
发展社会学研究室
主任：邹宇春(女)
副主任：崔岩
成员：范雷、任莉颖(女)、林红(女）、田志鹏
城市社会学研究室
主任：肖林
副主任：郑少雄
成员：鲍江、史云桐(女)、刘怡然(女)
农村社会学研究室
主任：张浩
副主任：张倩(女)
成员：荀丽丽(女)、刁鹏飞、张劼颖(女)
婚姻与家庭社会学研究室
主任：马春华(女)
副主任：施芸卿(女)
成员：张丽萍(女)、杭苏红(女)、黄添祺（女）
性别社会学研究室
副主任：杨可(女)
成员：吴小英(女)、范譞
青少年与教育社会学研究室
主任：李春玲(女)
副主任：刘保中
成员：石金群(女)、龚顺、李闯、胡含之(女)
社会心理学研究室
主任：陈满琪(女)
副主任：谭旭运
成员：应小萍(女)、王兵、张衍(女)
经济与科技社会学研究室
主任：吕鹏
副主任：付伟
成员：政光景、颜燕华(女)
社会工作与福利社会学研究室
主任：王晶(女)
副主任：梁晨(女)
成员：阎明(女)、张文博(女)、黄种滨
消费与文化社会学研究室
主任：朱迪(女)
成员：高文珺（女）、陈心想、黄燕华（女）
《社会学研究》编辑部
副主任：向静林
成员：赵梦瑶(女)、何钧力
《青年研究》编辑部
成员：徐宗阳
成员：李振刚
科研处
副处长：傅学军（主持工作）
成员：殷维、李乐、宋煜
行政办公室（含人事、党办）
主任：吕红新(女)
成员：夏 勤(女)（正处级调研员）、魏晓雷、杨晶晶(女)、张佳、冯琳惠（女）、孔鑫源(女)
